Первоначально Мацумото хотел стать профессиональным футболистом. Но, вдохновлённый мангой Кацухиро Отомо Domu, он выбрал карьеру мангаки.

Мацумото начал рисовать мангу в университете, а после дебютировал в журнале Afternoon, где была опубликована его работа Straight.

В 22 года мангака посетил Европу, и эта поездка оказала огромное влияние на его стиль. В частности, Мацумото впечатлили работы таких художников, как Жан Жиро (более известный под псевдонимом Мёбиус), Энки Билал и особено Мишель Прадо.

• ストレート (Straight) - 2 тома, 1988-89 г
• 点&面 (Ten to Men) - 11 историй, в виде отдельного тома не выходила, 1990 г
• ZERO - 2 тома 1990-91 г
• 花男 (Hanaotoko) - 3 тома, 1991-1992
• 青い春 (Blue Spring) - 1 том, 1993 г
• 鉄コン筋クリート (Tekkon Kinkurito, Black & White) - 3 тома, 1993-94 г. [ознакомиться]
• 日本の兄弟 (Brothers of Japan) - 1 том, 1995 г. [ознакомиться]
• ピンポン (Ping-Pong) - 5 томов, 1996-1997 г
• GOGOモンスター (GoGoMonster) - 1 том в 450 страниц, 2000 г
• ナンバーファイブ 吾 (No. 5) - 4 тома (в первом издании было 8 томов), 2000-2005 г
• 竹光侍 (Takemitsu Zamurai) - 6 томов, онгоинг, 2006 г
• 花 (Hana) - 1 том, 2005 г. [ознакомиться]
• 八月の金貨 (Hachigatsu no Kinka) - 1 том, 2002 г. Мацутомо выступал в качестве художника, автором был Яманака Хисаси
• 勘吉 (Kankichi) - отдельная история, 2005 год. Выходила в сборнике "Japan as Viewed by 17 Creators". [ознакомиться]
• こどものころにみた空は (Небо, которое я видел в детстве) - 1 том, 2002 г. Мацутомо выступал в качестве художника, автором была Наоко Кудо